敦化经济开发区是1992年8月13日经吉林省人民政府批准成立的省级经济开发区，规划面积为5.11平方公里，其中工业区5.01平方公里，商贸区0.1平方公里，工业起步区1.82平方公里。建区十几年来，敦化经济开发区从无到有，从小到大，先后经历了三个发展阶段：一是商贸起步阶段。1993年至1995年，以敖东商贸城建设为标志，开始了商贸区建设；二是存量发展阶段。1996年至1999年，以“区乡合一”为契机，以老企业嫁接改造为重点，靠存量发展积蓄力量；三是工业区起步阶段。2000年起，开发区坚持以项目建设为中心，加快工业区基础设施建设步伐，初步完成了工业区起步阶段的目标和任务，工业区建设初具规模。到2008年底，建成区面积达到382公顷，累计投入基础设施建设资金5.6亿元，工业区的起步区基本实现了“七通一平"。累计新上项目108项，累计入区企业完成投资额60.18亿元，累计固定资产投资48.89亿元。开发区初步形成了以木制品、制药、食品加工、机械加工四大支柱产业竞相发展的经济格局。

开发区管理机构为开发区管理委员会，是敦化市政府派出机构，代表市政府行使开发区总体规划执行、基础设施建设、招商引资、项目建设等职能。管委会人员编制总数为36人，其中行政编制29人,工勤编制7人。内设党政办公室、招商局、发展计划局、国土资源与规划建设局、财政投资局、项目服务局6个职能机构:另有公安分局、工商分局、国税分局、地税分局为派出机构。